Vaisala Oyj:n tilintarkastajia ovat KHT-yhteisö PriceWaterhouseCoopers Oy ja Hannu Pellinen KHT.
Tilintarkastuspalkkioita maksettiin vuonna 2009 yhteensä 251 000 euroa (175 000 euroa vuonna 2008) ja muita palkkioita euroa 310 000 (110 000 euroa vuonna 2008).
Vaisala-konsernin tilintarkastusyhteisö PriceWaterhouseCoopersille maksamat tilintarkastuspalkkiot vuonna 2009 olivat 241 000 euroa (135 000 euroa vuonna 2008) ja muut palkkiot 250 000 euroa (90 000 euroa vuonna 2008). Muille yhteisöille maksetut tilintarkastuspalkkiot vuonna 2009 olivat 10 000 euroa (40 000 euroa vuonna 2008) ja muut palkkiot 60 000 euroa (20 000 euroa vuonna 2008).